一个涉及500多名科学家的全球联盟，称为COVID-19 MS联盟，本周早些时候宣布柳叶刀。该联盟旨在共享有关新冠肺炎这是从质谱实验中得出的，尤其是重点是患者血液的分子变化，发现新的生物标志物以及推断该病毒峰值蛋白和其他抗原的分子特征。

COVID-19 MS联盟由曼彻斯特大学并由世界许多领先的质谱专家组成。捷克葡萄牙直播与之交谈佩迪塔·巴兰（Perdita Barran），曼彻斯特大学的质谱教授，以了解建立联盟的基本原理，研究人员如何合作以及如何共享和使用数据。

MOLLY CAMPBELL（MC）：您能否扩大建立Covid-19质谱联盟的基本原理？您的主要目标/目标是什么？

佩迪塔·巴兰（PB）：我们的理由是基于在非常需要测量的时期作为测量科学家！我们共同花时间讨论我们能做的最好的事情，并在与临床医生和病毒学家协商时，我们认为质谱有两个广泛的领域可以帮助：即寻找体液（血清，唾液和SEBUM和SEBUM）的预后标记）并映射病毒抗原的结构，动力学和相互作用。

我们很早就决定，使用相同的方法在可能的情况下使用相同的方法收集和处理，以帮助在一个地方进行协调和分类输出。

Karen Steward（KS）：您希望该联盟的主要成果是什么？

PB：我希望我们将提供来自多素学研究的大型可比数据集，以表明疾病的进展，以便可以在医院中使用预后标记分析，以帮助临床医生决定如何治疗个人。

我们还认为，这些“ OMICS”数据集将揭示感染性的机制，尤其是对某些人更容易对SARS-COV-2进行严重反应的见解。我们想找出为什么一些潜在的疾病（例如糖尿病）使人们更有可能被送往医院。我们还想了解为什么男人和黑人，亚洲和少数族裔人口似乎更容易受到影响。

所有这些输出都将有助于治疗，还采取公共卫生措施来保护人们免受感染。

对于病毒抗原工作，我们想了解激活受体结合的尖峰蛋白的动力学。我们还想查看病毒机械的其他部分。使用氢氘交换 - 质谱法（HDX -MS），我们将绘制保护性糖涂层在病毒尖峰蛋白上的作用。最初的工作将集中在病毒的重组形式上，后来侧重于实际病毒的灭活形式。

MC：对于我们可能不熟悉该技术的读者，请您简要说明如何在研究中使用质谱并与Covid-19作斗争？

PB：质谱法可以从生物流体中识别和量化蛋白质，脂质和代谢物。通过测量血液样本中的这些分子并比较患者之间的数量，并且在疾病进展的每个患者中，我们将能够确定发生了哪些生化过程。通过查看这些变化并添加有关个体的元数据和临床数据，我们将确定可靠的生物标志物。

结构质谱法使我们能够检查蛋白质和蛋白质复合物构象的变化。

MC：该财团包括来自全球的成员。您如何共同努力并进行交流以实现联盟的目标？

PB：许多国家都任命了国家冠军来协调国家活动。我们使用电子邮件和社交媒体来更新会员，当然，在英国，我们有定期的视频会议。当人们向我们发送数据输出时，我们正在更新网站上的数据目录，并且我们正在与欧盟数据门户合作。

KS：您认为生成的数据如何最好以可用，安全的方式共享？

PB：我们鼓励人们使用社区数据存储库，例如自豪用于蛋白质组学，以及代谢用于代谢组学。元数据当然必须匿名化。在英国，我们正在从患者和样本中收集元数据ISARIC协议（世界卫生组织推荐），我们建议大家尽可能地这样做。我们还要求成员告诉我们加入数据集的数字和简要摘要。

MC：利用质谱法进行SARS-COV-2研究时会有什么挑战？

PB：样品将在非常不同的情况下收集，并以不同的方式存储和处理，因此元数据的质量可能会有所不同。随着疾病的流行，与临床潜在客户一起工作将变得更加容易，并将其与临床上的OMICS数据结合起来，以试图统一这一点 - 实际上，在英国，这就是我们正在做的事情。我们的目标是一旦获得足够的样本和数据，就可以从发现转变为目标质谱法。我们选择以速度进行复制研究的方法旨在实现这一目标。我们还与国家测量实验室LGC和质谱制造商合作。

KS：在SARS-COV-2大流行通过后，您认为该财团可能在解决其他全球疾病问题方面发挥作用吗？

PB：我认为我们所有人都将更加有动力进行研究，以防止或最大程度地减少Covid-19和未来疾病的伤害。我非常担心它将如何影响发展中国家的人们。我们还需要在公共卫生问题上进行协作。我们应该尝试进行许多严重的疾病，采用一种更协作的方法，而不是竞争性的，例如结核病和疟疾。

曼彻斯特大学质谱学教授佩迪塔·巴兰（Perdita Barran）正在与科学作家Karen Steward和Molly Campbell博士，技术网络进行了交谈。捷克葡萄牙直播