地球上最早的动物之一是珊瑚礁中的海绵，比珊瑚礁的邻居不那么浮华，但对礁石的整体健康很重要。

从联合国同伴到珊瑚礁生态系统的新研究采用了一种新的方法来理解与它们共生的海绵和微生物的复杂演化。借助这种“基因组时间机”，研究人员可以通过数亿年的巨大进化变化来预测礁和海洋生态系统的各个方面。

“这项研究表明，微生物组如何在一组超过7亿年的生物中进化，”Sabrina Pankey，研究后的博士后研究员和该研究的主要作者，最近发表在《杂志》上自然生态与进化。“由于气候变化的响应，海绵的礁石量增加了，它们在水质和养分固定中起着巨大的作用。”

不过，工作的意义超越了海绵，为基于基因组学理解过去的新方法提供了新的方法。“如果我们可以重建像这样复杂的微生物社区的进化史，我们可以对地球的过去说很多话，”研究合着者说赌欧洲杯赔率大卫·普拉切茨基（David Plachetzki），UNH分子，细胞和生物医学科学副教授。“Research like this could reveal aspects of the chemical composition of the Earth’s oceans going back to before modern coral reefs even existed, or it could provide insights on the tumult that marine ecosystems experienced in the aftermath of the greatest extinction in history that took place about 252 million years ago.”

“这样的研究可以揭示地球海洋化学成分的各个方面，可以追溯到现代珊瑚礁甚至存在之前。”

研究人员使用机器学习方法对整个加勒比海地区的几乎100种海绵物种进行了描述，以建模海绵独特的微生物组的身份和丰度，即在共生中生活的微生物和细菌群落。他们发现了两种不同的微生物组成分，这些成分导致了用于喂养的不同策略（海绵通过泵送水通过其身体捕获营养）并保护自己免受捕食者的影响 - 甚至在并排生长在礁石上的物种中。

Plachetzki说：“我们在本文中描述的共生赌欧洲杯赔率社区的类型非常复杂，但我们可以证明它们多次独立发展。”

而且，Pankey补充说：“这些微生物群落正在做什么，这是非常具体的……海绵大量的次数已经决定，这种多样的微生物安排为他们服务。”赌欧洲杯赔率

Leveraging this new genomic approach, the researchers found that the origin of one of these distinct microbiomes, which had a high microbial abundance (HMA) of more than a billion microbes per gram of tissue, occurred at a time when the Earth’s oceans underwent a significant change in biogeochemistry coincident with the origins of modern coral reefs.

尽管机器学习和基因组测序产生了发现的发现，Plachetzki称“微生物条形码测序的旅游力”，但这项研究始于加勒比海的温暖水域。

潘基说：“我们为所有1,400个样品的所有样品涂鸦。”他在2017年和2018年进行了五次探险，以收集海绵。她补充说：“这是一个可怕的收藏，”他承认，在加勒比海潜水有其回报。二人组合合着者迈克尔·莱瑟（Michael Lesser），荣誉研究教授，建立了现场工作技术，并从密西西比大学和阿根廷的纳纳西尼大学Del Comahue大学提供了协助海绵收集和分子鉴定。前研究生Keir Macartney也为这项研究做出了贡献。

参考：Sabrina Pankey M，Plachetzki DC，Macartney KJ等。Cophyly和Cnervence塑造了海绵 - 微生物共生中的Holobiont进化。自然生态与进化。2022. doi：10.1038/S41559-022-01712-3。

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