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表型与基于目标的药物筛查比利时罗马尼亚比分直播
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在过去的二十年中,基于目标的筛查一直是药物发现的首选方法,但是比利时罗马尼亚比分直播表型筛选有一些文艺复兴时期。我们研究两者的优势和应用。

每种筛选方法都涉及什么?


当今的许多药物都是通过表型筛选发现的 - 在细胞,分离的组织或器官或动物中测试分子,以查看其是否施加所需的作用。该药物发挥其作用的实际机制(其靶标)通常以后确定,有时不多年。

从历史上看,表型筛查在识别一流的药物方面具有略有优势,而基于目标的筛查产生了更多的一流药物。1这归因于识别药物的作用机理时缺乏偏见。但是,在鉴定细胞活性化合物方面,表型测定也更有利伊丽莎白·莎洛教授来自美国弗吉尼亚州弗吉尼亚大学医学院。

她说:“表型测定法很具有挑战性,因为通常需要复杂的下游目标反卷积方法。”“而且,在某些情况下,它们也是更多的时间来实施,从长远来看可能会影响吞吐量。所有这些都需要纳入整体筛选范式和筛选策略的成本。”

This lack of throughput, accompanied by the revolution in genomics, has led to drug companies and academia adopting a ‘target-first’ approach for many years, where a molecule known to be important in a disease process is used to screen vast compound libraries in the search for a ‘hit’ – a candidate drug. One advantage of such an approach, is that you can screen many millions of drug-like molecules, knowing that if you get a hit, you already have a candidate that is close to becoming a potential drug.

Sharlow教授指出:“总体而言,基于目标的分析的实施时间较少,但有时会受到诸如酶活性等标准读数的挑战。”“然后是基于蛋白质蛋白质相互作用的基于靶标的测定法,虽然在生理上更有趣,但实施更为复杂。

她说,最终,两种筛查策略对于化学探测和/或药物发现都是有价值的,并且必不可少,而且通常,特定的筛选策略取决于您可用的资源。比利时罗马尼亚比分直播

但是,从药物发现的角度来看,表型比利时罗马尼亚比分直播筛查似乎有些复兴。


最佳点 - 一种组合的靶向表型方法


“Doing drug discovery screens within the cellular context already answers a few of the questions that bedevil the drug discovery process later on, such as ‘how do I make this more soluble?’, or ‘how do I get this into cells?’” says迈克·豪威尔博士,在英国伦敦弗朗西斯·克里克学院(Francis Crick Institute)放映负责人。“如果您是医学化学家,那么您可能会正确地认为,您可以使用魔法来制作不太可溶的东西或不太擅长进入细胞,更好地进入细胞。但是,有一种感觉,如果您从基于细胞的良好测定中开始,那么您就通过设计固有地跳出了其中的一些障碍。”

豪威尔说,最佳点是两种方法越来越多地组合的方式。“许多人会希望屏幕查看蛋白质在细胞环境中的活性或定位 - 因此,它在一定程度上既基于目标又基于表型。”

在弗朗西斯·克里克学院(Francis Crick Institute)中,豪威尔(Howell)解释说,它们对表型方法的误解,因为它们主要使用基于细胞的基于细胞的测定,这些测定对特定过程具有所有细胞的影响,但他们将主要研究该过程的一个方面,例如作为下游目标的磷酸化。“我们使用基于细胞的测定的高含量图像分析。这意味着您可以测量多个蜂窝读数以量化主要目标响应并使用其他表型数据对这些响应进行分类,以使某些其他功能告诉您更多有关您打算研究的过程的更多信息”

表型筛查 - 下一水平


通过技术的进步可以更微妙地操纵细胞中的分子过程,这已经实现了这两种方法。“我们生活在一个时代,我们经历了一种使用siRNA击倒基因的方式,现在每个人都在使用CRISPR进行。一个有趣的点是人们看到的不同结果。它只是强调的是没有完美的技术,因为他们每个人都以不同的方式提出不同的问题。”豪厄尔说。

Howell说,CRISPR已经开辟了许多以前无法探索的问题。曾经很难的简单过表达屏幕,因为它们需要转染cDNA并以比必要的高得多的水平过表达它们,现在更容易控制。现在,一系列新型CRISPR技术的可用性和使用可以使传统高通量筛选的细胞模型的产生能够生成,但更加紧密地对患病的细胞状态进行了建模。我并不是说这很容易,但是这些事情现在是可能的。”

生物测定总是答案吗?


那么,将这些筛选方法提升到一个新的水平?Sharlow引用了更相关的测定系统(例如诱导的多能干细胞和类器官)的使用作为令人兴奋的,以及愿意以较小的规模进行筛选(相对于数百万个化学型筛选)。“这允许使用复杂的测定读数,包括3D配置的读数,并可能有助于将技术转换为诊所。”

Howell说,在癌症等疾病过程中,将免疫系统的影响到屏幕上的影响非常重要。“下一代表型筛查确实必须包括其他一些具有多细胞环境,3D环境,其他组织的影响,其他系统的影响的方法。”

但是,如果没有必要,也有使屏幕过于复杂的风险,豪威尔警告说:“人们想做最真实的测定法,或者尽可能接近现实生活。始终值得质疑是否有证据支持这样做,或者我们是否只是在做一个难以通过困难而感到善良的事情。在某种程度上,这取决于您要获得的信息。如果您想为人类生产药物,我认为最终更复杂的实验可能会更有益。如果您想发现有关您最喜欢的细胞系统进行研究的信息,那么也许不是。”

答案是,一种全面的筛选策略将同时纳入目标和表型测定,一种格式指定为主要屏幕,另一种格式为二次或后续测定。

霍维尔总结说:“您总是可以说,这些信息将从表型测定中更丰富,但是世界仍然需要制造与特定蛋白质结合的特定分子。答案不是要使用一个或另一个,您都需要两者。”

参考
1. Swinney,D。C.(2013)。表型与基于目标的一流药物的药物发现。比利时罗马尼亚比分直播临床药理学与治疗学,93(4),299-301。doi:10.1038/clpt.2012.236


认识作者
乔安娜·欧文斯(Joanna Owens),博士
乔安娜·欧文斯(Joanna Owens),博士
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