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研究人员确定犬冠状病毒峰值蛋白中发生的模式
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康奈尔研究人员已经确定了在犬冠状病毒中发生的转变,该转变指向其他冠状病毒中可能的变化模式,并可能为它们如何从动物传递给人类。


在2017 - 18年度患肺炎的两名马来西亚人类患者中,首次发现了一种新的犬冠状病毒。其他一群科学家隔离了犬冠状病毒,对其进行了测序,并于2021年发表了他们的发现。


现在,由康奈尔大学和坦普尔大学研究人员领导的一支团队已经确定了一种模式,该模式发生在犬冠状病毒尖峰蛋白的末端 - 病毒区域促进进入宿主细胞的病毒:该病毒从感染肠和呼吸系统转变动物宿主的系统仅感染人类宿主中的呼吸系统。


研究人员确定了末端的变化(称为n末端),该区域在另一个冠状病毒中也发现了改变的分子区域,该区域从蝙蝠跳到人类,在该冠状病毒中,它导致了普通的感冒。


纸,“犬冠状病毒的最近的人畜共动性溢出和向性转移与Spike蛋白NTD子域中的轻松选择和假定的功能丧失有关,” 4月21日发表在《杂志病毒》中。


“这项研究确定了从狗冠状病毒到新宿主的宿主转变的基础的某些分子机制,这在我们以前不知道的新人类冠状病毒的循环中也可能很重要。”迈克尔·斯坦霍普,兽医学院公共和生态系统健康教授。第一作者乔丹·泽尔(Jordan Zehr)是合着者Sergei Kosakovsky Pond的实验室的博士生,Temple University基因组学和进化医学研究所生物学教授。


在这项研究中,研究人员使用了池塘实验室中开发的最先进的分子进化工具来评估自然选择的压力如何影响犬冠状病毒的进化。


在人类中,字母内病毒(犬冠状病毒被分类的属)与为了进入人类细胞的结合的主要受体称为APN,但也有共受体。这些共受体之一是唾液酸,在多种哺乳动物的胃肠道细胞中发现。研究人员确定了N末端中尖峰蛋白的区域,称为O-域,该域以与唾液酸结合而闻名。在对马来西亚患者发现的犬冠状病毒的分析中,O域的一部分以独特的方式发生变化。


在马来西亚患者中发现的犬冠状病毒似乎正在失去其O域,但并非完全。Stanhope说:“但是它具有分子进化史,表明唾液酸结合区域不再从事相同的工作。”研究人员发现了“放松进化”的证据,其中自然选择的压力减少了,这有助于转变。


研究人员将O域的这种转变和损失与其他相关冠状病毒进行了比较。一种称为可传染性胃肠炎病毒(TGEV),会感染猪并引起呼吸道和肠道疾病。该猪病毒的一种称为猪呼吸冠状病毒的变体几乎与TGEV相同,但它失去了O域,完全是一种呼吸道病原体。同样,一种已知引起人类感冒的冠状病毒起源于蝙蝠作为胃肠道病毒,失去其O域,并跳到人类宿主作为呼吸道病毒。


“So this is a pattern that seems to be repeating itself in coronavirus evolution and in particular in coronavirus evolution associated with these tropism shifts, where we go from a gastrointestinal infection originally and then jumping to an alternate host, where it’s now respiratory,” Stanhope said.


在2021年,在海地的一些人也有呼吸道疾病的人,在2021年,在马来西亚发现了同样的犬冠状病毒。需要进行更多的研究来了解病毒的转变和跳向人类是否自发发生在世界各地,或者该冠状病毒(代表了第八个已知的人类冠状病毒)是否已经在人群中流传了数十年,未经发现,未检测到。斯坦霍普说。


SARS-COV2的N末端结构域(导致Covid-19)正在受到研究人员的越来越多的关注,这项研究提供了更多的理由,以关注分子的这一特定区域。


合着者包括劳拉·古德曼,公共与生态系统健康系助理研究教授和贝克动物健康研究所;加里·惠特克(Gary Whittaker),微生物和免疫学系病毒学教授;和克里斯蒂娜·塞雷斯(Kristina Ceres),一名博士生,与斯坦霍普(Stanhope)和古德曼(Goodman)紧密合作。古德曼和惠特克都是康奈尔·玛格丽特和理查德·里尼犬健康中心的一部分。


参考:Zehr JD,Pond SLK,Martin DP等。犬冠状病毒的最近的人畜共动性溢出和向性转移与Spike蛋白NTD子域中的轻松选择和假定的功能丧失有关。病毒。2022; 14(5):853。doi:10.3390/V14050853

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