psilocybe cubensis是一种合成治疗量psilocybin，psilocin和其他活性色胺的真菌。了解该合成途径中的遗传变异可以阐明负责特定化学型的变体。为了更好地了解这种多样性，我们首先建立了一个参考年级基因组psilocybe cubensis。使用Pacific Biosciences HIFI测序和相基因组接近连接测定法（HIC），我们构建了染色体尺度，注释的参考基因组psilocybe cubensis。使用此参考基因组，我们已经测序并映射了一个81psilocybe基因组分类该属中经常发现的遗传多样性和微生物污染物。多路复用定量聚合酶链反应（QPCR）设计用于同时量化大肠杆菌和沙门氏菌物种污染与psilocybe cubensis物种识别。这些工具可以帮助定向物种的育种，污染物识别和p。cubensis物种验证。
在本网络研讨会期间，我们将探索：
- 遗传变异psilocybe cubensis合成途径
- QPCR分析的设计，用于同时量化大肠杆菌和沙门氏菌物种污染与psilocybe cubensis物种识别
