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psilocybe cubensis繁殖的基因组工具
网络研讨会

psilocybe cubensis繁殖的基因组工具

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网络研讨会

psilocybe cubensis繁殖的基因组工具

凯文·麦凯南(Kevin McKernan)
凯文·麦凯南(Kevin McKernan)
CSO,药物基因组学

psilocybe cubensis是一种合成治疗量psilocybin,psilocin和其他活性色胺的真菌。了解该合成途径中的遗传变异可以阐明负责特定化学型的变体。为了更好地了解这种多样性,我们首先建立了一个参考年级基因组psilocybe cubensis。使用Pacific Biosciences HIFI测序和相基因组接近连接测定法(HIC),我们构建了染色体尺度,注释的参考基因组psilocybe cubensis。使用此参考基因组,我们已经测序并映射了一个81psilocybe基因组分类该属中经常发现的遗传多样性和微生物污染物。多重定量聚合酶链反应(QPCR)测定已设计用于同时定量大肠杆菌沙门氏菌物种污染与psilocybe cubensis物种识别。这些工具可以帮助定向物种的育种,污染物识别和p。cubensis物种验证。

在本网络研讨会期间,我们将探索:

  • 遗传变异psilocybe cubensis合成途径
  • QPCR分析的设计,用于同时量化大肠杆菌沙门氏菌物种污染与psilocybe cubensis物种识别
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