欧洲蛋白质组学基础设施联盟提供访问（Epic-xs）始于2019年1月。它汇集了一个世界领先，高度创新的欧洲蛋白质组学设施的联盟，并共同提供了支持欧洲出色的生活科学研究的共同目标。这是通过提供对尖端蛋白质组学设施的访问来实现的，包括从现场专家那里获得专家设计和数据分析的支持。该计划还旨在开发和实施新型的质谱法（MS）基于基于的蛋白质组学和生物信息学方法，以塑造欧洲未来的生命科学研究。它是作为欧盟Horizo​​n 2020工作计划的一部分资助的，由乌得勒支大学（Utrecht University）项目协调员兼生物分子MS和蛋白质组学教授Albert Heck教授协调。

EPIC-XS中的跨国访问包括大约2400天进入最先进的蛋白质组学设施，并由国际独立审查小组评估，确保了卓越和匹配用户的最佳设施，以解决其具有挑战性的研究问题。

Miriam Abele和Franziska Hackbarth在德国慕尼黑技术大学巴伐利亚生物分子质谱中心的通道中维护质谱仪的液相色谱系统。信用：Epic-XS。

MS概述

在这个为期四年的项目中，几乎三分之二的方法是对获得尖端蛋白质组学技术的科学需求，导致了250多种应用。用户应用的地理分布源于中欧的主要以及欧盟相关的国家，例如瑞士，挪威和土耳其，以及来自欧盟六个国家的六个国家 /地区的代表：克罗地亚，波兰，波兰，斯洛伐克，斯洛伐克，塞浦路斯和塞浦路斯和欧盟。捷克共和国。值得注意的是，加拿大和美国也要求访问，表明Epic-XS已获得全球认可。

这样的重要访问要求可能是由于生命科学研究人员目前面临的许多挑战。许多临床实验室和研究机构对蛋白质组学的广泛使用可能会因MS仪器的高成本所阻碍，包括维护这些复杂机器，其计算能力和昂贵的消耗品的成本。获得，培训和保留高素质的人员的需求意味着MS设备的长期可持续性可能具有挑战性。

用户在EPIC-XS访问站点进行的实验已经提供了见解：

• 蛋白质蛋白相互作用研究
• 蛋白质功能
• 蛋白质修饰
• 蛋白质定位研究

产生跨越整个生命科学领域的信息，包括针对潜在疾病生物标志物的发展，最终可以用于疾病检测，治疗以及在某些情况下 - 避免，开发安全的食品，这些食品是安全的，并为我们的健康和研究做出了良好的健康和研究新型设计师作物的发展。在这里，我们看看一些Epic-XS联盟用户的工作。

公共和私人研究机构的用户

来自细胞分子生物学系的Malgorzata Heidorn-Czarna博士， 弗罗茨瓦夫大学 波兰正在调查全球快速变暖对植物生长的后果。马尔戈扎塔（Malgorzata）的工作从蛋白质组学科学家那里获得了专业知识 VLAAMS研究所生物技术 - 绅士大学 ， 比利时。这些科学家是N末端Cofradic程序的专家，非常适合鉴定蛋白酶底物，帮助Malgorzata了解OMA1和I-AAA的作用（ FTSH4 ）线粒体膜蛋白酶在植物热应激中。 正在进行的Cofradic分析将揭示这两种蛋白酶的特定裂解位点，这是一种在波兰无法进行的屏幕。

“b y可以跨国访问 EPIC-XS财团和该计划的资金中的专业知识，在很短的时间内使这些实验成为可能，” - Malgorzata。

Esteban Gurzov博士，小组负责人 信号转导和代谢实验室，，，，Libre大学， 布鲁塞尔，受益于跨国访问的优势赫克实验室。古尔佐夫的小组着重研究磷酸酶在代谢中的作用以及与肥胖相关并发症（如癌症）的影响。他的愿景是研究代谢性疾病，以寻找治疗这些病理的新靶标。该实验室利用具有多种技术的小鼠模型和人体组织来研究代谢中的细胞功能障碍，包括代谢疾病的动物模型，基因表达，RNASEQ，siRNA，qPCR和Western印迹分析以识别相关的基因和信号通路。

“在过去的几个月中，我的研究从Epic-XS倡议中受益匪浅。可以为表达和活跃的全面屏幕执行全面的屏幕 转移后紫红色（ PTPS ） 来自极为有限的人类肝组织活检，” - Gurzov。

Gurzov的一些研究发现的专利已经提交。

协同作用：访问站点和研究人员

这用户与EPIC-XS访问网站研究科学家之间的合作有 被证明是无价的ingydF4y2Ba回答ing当前的生命科学研究问题并为未来的研究开辟了一些令人兴奋的可能性。访问网站巴伐利亚生物分子MS中心（ Baybioms ），慕尼黑技术大学（TUM）帮助包括Sven Van Bael博士在内的众多研究人员比利时Ku Leuven 和西尔维斯特·霍尔特博士来自 科特大学阿祖尔大学 ，，，， 法国。范贝尔的研究重点是神经肽的功能及其相应的行为效应。 由于神经肽功能的广泛进化保守性，通常在无脊椎动物模型系统中研究它们，在这种情况下为线虫秀丽隐杆线虫。神经肽的典型特征是体内处理，导致短暂（ 〜 10个氨基酸）序列含有相对较少的碱性氨基酸，从而成功进行LC-MS/MS检测具有挑战性。到目前为止，大多数范贝尔的肽组学研究基于数据依赖性获取（DDA）MS和wHile DDA非常适合发现目的，其整体可重复性低使它成为现实不合适用于准确的差异研究。这TUM访问站点由于他们的专业知识，这是一个简单的选择具有不同的靶向蛋白质组学策略，例如平行反应监测（PRM）和数据无关的获取（DIA）。

“ Epic-XS授予我直接与目标MS领域的专家进行互动的可能性。他们的经验和意见对我目前的研究非常有帮助，这将是我未来职业的我所带来的。”范贝尔。

霍尔特博士调查这酵母模型系统中人类癌突变的扰动的分子效应 。在2018年群组共同发布了1011酵母基因组资源 自然 ，需要从各种天然和家庭壁ni中隔离的酵母菌菌株。蒂建立的酵母资源将会被使用研究耐药性的机制，专门针对MTOR抑制剂，并比较不同酵母分离株之间的这些机制。

“ 没有Epic-XS，这个项目将永远无法达到当前 科学卓越水平 。 获得Epic-XS赠款对我和我的科学职业的前进势头都是非常积极的经历。” 霍尔特。

EPIC-XS不会限制其在生命科学中对特定流派的访问，并为更广泛而完整的研究项目提供了帮助。这包括动物和兽医科学研究的重大进步，该领域直到过去十年才传统地使用蛋白质组学技术。 AndréM。De Almeida博士， 里斯本大学 ，葡萄牙，充分支持该计划。

“ Epic-XS对于诸如动物和兽医科学等领域尤为重要，尽管在过去的十年中增加了蛋白质组学的使用并不常见。这允许更广泛而完整的研究项目有效地补充传统方法，” - de almeida。

工业用户 尽管大多数用户来自学术界和其他研究机构，但工业用户也受益于跨国访问和与蛋白质组学的直接沟通。 Kristina Masson博士，联合创始人兼全球运营主管 Acrivon 治疗学解释说：

“我们的项目涉及不同肿瘤模型中药物的蛋白质组学分析。作为一家资源非常有限的小型生物技术初创公司，这种平台的支持非常有价值，并且成为该财团的一部分是一个很好的体验，” - - ” - 马森。

与大多数Epic-XS用户相反， 首席执行官兼创始人 Spectroswiss Yury Tsybin博士 主要兴趣是自上而下的和中 - 中 - 蛋白质相分析。这项研究需要特定的专业知识和MS功能。他选择在法国领导的巴斯德研究所的生物学实验室的MS选择 朱莉娅·肖诺特·罗克（Julia Chamot-Rooke）博士 是一个显而易见的。

“提供的财政支持在实现此类项目方面起着重要作用。我们设想获得的结果，以直接影响我们（和其他人）将在不久的将来对单克隆抗体以及潜在的其他复杂蛋白进行结构分析，” - 尤里。

未来的影响

Epic-XS可以通过其灵活性来获得其成就，从而在生命科学中的所有科学鸿沟中提供从新手到经验丰富的研究人员的访问权。

联盟成员和用户都强烈提倡该框架的独特性，例如，在提供自上而下的蛋白质组学时。参加17^Thannual US HUPO workshop on Top-down proteomics (8-12 March 2021), Yury Tsybin and Julia Chamot-Rooke’s (Institut Pasteur, access site manager) enthusiasm for EPIC-XS has compelled US researchers to consider implementing the EPIC-XS model in a similar US framework.

目前，有更多的同行评审出版物还有更多的准备。其中大多数来自四项联合研究活动（JRA）在财团的研究小组中。这并不奇怪，因为Epic-XS仅有两年的存在，并且用户可能需要数月来编译数据和准备手稿。

可以在此处提供完整的用户出版物列表以及提交提交的详细信息。Epic-XS网站。

关于作者

自2019年1月这项蛋白质组学计划开始以来，Martina O'Flaherty是专门的Epic-XS项目经理。Martina具有生物化学和MS的背景，并在乌得勒支大学（Utrecht University）设立了她的身份乌得勒支分子免疫学集线器阿尔伯特·赫克（Albert Heck）研究项目。