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蛋白质组学研究的最新发展
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蛋白质组学研究的最新发展

蛋白质组学研究的最新发展
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蛋白质组学研究的最新发展

术语蛋白质组学(用于描述蛋白质的大规模表征)是在1990年代创造的马克·威尔金斯,当时是一名博士生。从那时起,该领域已经获得了动力,现在可以细分为各个研究领域 - 从蛋白质表达分析和蛋白质组挖掘到结构和功能蛋白质组学以及蛋白质相互作用。A cell’s proteome reflects the immediate environment in which it is studied, and various proteomics techniques can be exploited to identify the “set” of proteins within a cell, in turn helping to create an intricate map of the cell, to determine the exact location of individual proteins.

在这里,我们仔细研究了蛋白质组学研究领域的一些最新发展。

新方法产生膀胱癌的潜在药物候选药物


科学家的国际合作开发了一种新的分子药物设计方法,从而可以生产有前途的膀胱癌药物。该团队将“本质上混乱的蛋白质”(IDP)概念应用于他们的工作。本质上无序的蛋白质构成人类蛋白质组的50%> 50% - 它们的适应和变化形状的能力使它们可以结合不同的表面,在某些情况下,它们会导致功能增长。这个概念可以解释为什么基于“锁定和关键”方法的药物在临床上取得成功有限。当在临床试验中进行测试时,这种新型药物诱导了癌细胞的快速脱落,并导致肿瘤大小显着降低。

“这项研究非常令人兴奋,因为临床试验对减少这种形式的膀胱癌患者的肿瘤大小的影响很大,没有任何副作用。”三位一体生物化学和免疫学学校副教授,三一生物医学学院副教授肯·H·莫克(Ken H Mok)说科学研究所。“从科学的角度来看
- 并致力于对其他治疗发现的巨大潜力 - 为一种全新的分子药物设计做出了贡献,这也是非常令人兴奋的。”

参考:
Brisuda A,Ho JCS,Kandiyal PS等。膀胱癌治疗使用构象上的液体肿瘤肽复合物。纳特社区。2021; 12(1):3427。doi:10.1038/s41467-021-23748-y

早期发现阿尔茨海默氏病的血液检查

为了诊断阿尔茨海默氏病(AD),临床医生目前依赖于包括认知测试,脑成像和腰椎穿刺的技术组合。这些方法在许多国家 /地区都很昂贵,侵入性且经常无法使用。为了帮助解决与这些方法相关的短缺,研究人员设计了针对AD的高性能,基于血液的测试。该测试依赖于生物标志物面板和区分AD早期,中级和晚期患者的系统。因此,该测试可用于诊断和疾病进展监测。

教授说:“随着超敏感的血液基蛋白检测技术的发展,我们为AD开发了一种简单,无创和准确的诊断解决方案,这将极大地促进该疾病的人口规模筛查和分期。”南希IP,Morningside生命科学教授和HKUST的国家分子神经科学的主要实验室主任。

参考:
Jiang Y,周X,IP FC等。大规模的血浆蛋白质组学分析确定了一个高性能的生物标记面板,用于阿尔茨海默氏病筛查和分期。阿尔茨海默氏症痴呆症。2021. doi:10.1002/alz.12369

可以使用锥形蜗牛毒液治疗严重的疟疾

即使在治疗当前可用的寄生虫药物后,严重的疟疾形式也可能是致命的。这是由于尽管存在寄生虫,但仍存在于宿主细胞内,死亡。因此,抗粘附药可能是显着提高生存率的关键。对生产的毒液的新研究Conus nux,一种海蜗牛物种,揭示了其破坏特定相互作用的能力(蛋白质 - 丙糖糖和蛋白质 - 蛋白质),从而有助于疟疾的病理学。因此,这些结合毒素可用于开发新颖和具有成本效益的抗粘附药物或设计的封锁治疗治疗严重疟疾。

“在850多种锥形蜗牛中,有成千上万种不同的毒液外肽在整个数百万年的进化中都被选中,以捕获其猎物和抑制掠食者。”弗兰克·玛丽(FrankMarí),博士,美国国家标准技术学院生物化学科学的通讯作者兼高级顾问。“他们这样做是通过靶向目标可激发细胞中存在的几种表面蛋白。可以探索这种巨大的生物分子培养基库,以便潜在使用,以作为针对影响非驱散系统的持续性和新兴疾病的治疗铅。”

参考:
Padilla A,Dovell S,Chesnokov O,Hoggard M,Oleinikov AV,MaríF。Conus毒液馏分抑制了恶性疟原虫红细胞膜膜蛋白1域对宿主血管受体的粘附。J. Proteom。2021; 234:104083。doi:10.1016/j.jprot.2020.104083

蛋白质组学证实了SARS-COV-2从母亲到胎儿的垂直传播

Skoltech科学技术研究所的研究团队开发了一种基于质谱的诊断方法,以检测SARS-COV-2从母亲到胎儿的垂直传播。该研究发表在病毒,评估了一名健康的27岁妇女的情况,该妇女与Covid-19一起“中度病态”
在她身上 21英石妊娠一周。孩子过早地分娩(26Th妊娠一周)并在不久之后死亡。The study’s senior author, Evgeny Nikolaev, explained that the proteomics-based method was the most reliable method to use to determine vertical transmission, as it can identify viral proteins with 100% confidence – something that cannot be achieved using other methods, such as PCR.

“我们使用特定的酶(胰蛋白酶)切割从病毒中分离的N和S蛋白,并在质谱仪上检测它们。我们使用标准电离方法 - 电喷雾。然后,我们在质量中搜索质量的特定氨基酸序列。Skoltech科学技术研究所计算与数据密集型科学与工程中心教授Evgeny Nikolaev说:“光谱数据使用标准蛋白质组学技术。”

参考:Sukhikh G,Petrova U,Prikhodko A等。SARS-COV-2在第二学期的垂直传播与严重的新生儿病理有关。病毒。2021; 13(3):447。doi:10.3390/V13030447

探测蛋白质组学景观
发现药物靶标的癌症

贝勒医学院的科学家表明,通过分析侵略性人类癌的蛋白质数据,可以发现可以被用作治疗靶标的疾病的关键驱动因素。该小组研究了七种特定的癌症类型(乳腺癌,结肠,肾脏,肺,卵巢,子宫和神经胶质瘤),并希望确定与侵袭性疾病的临床指标有关的“蛋白质组学特征”。癌症类型之间共享了一些特征,包括改变代谢的细胞途径。

贝勒(Baylor)助理教授戴安娜·蒙西瓦(Diana Monsivais)说:“我们的实验提供了概念概念,即蛋白质组学分析是一种有用的策略,这不仅是更好地了解什么驱动癌症,而且是确定控制或消除它的新方法。”医学院。

参考:
Monsivais D,Vasquez YM,Chen F等。基于质谱的蛋白质组学相关性的等级和阶段揭示了与侵略性人类癌有关的途径和激酶。癌基因。2021; 40(11):2081-2095。doi:10.1038/s41388-021-01681-0

认识作者
Laura Elizabeth Lansdowne
Laura Elizabeth Lansdowne
总编辑
凯特·罗宾逊
凯特·罗宾逊
编辑助理
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