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现代微阵列技术的创新和多功能性

Results of a cDNA microarray, reflecting the gene expression differences between two different tissues.
Credit: National Cancer Institute

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Microarrays have been critical components of biomedical and clinical research strategies since their first mention in a1995年研究。最初设计用于测量基因表达或转录,此技术已扩展并改进,以分析许多其他生化样品类型,例如蛋白质或小分子。


New and innovative advancements in microarray technology mean that modern microarrays remain a fast and reliable solution for a variety of high-throughput needs, supporting fields such as biomarker and drug discovery.


要了解有关现代微阵列技术提供的机会的更多信息,捷克葡萄牙直播与之交谈Iain McWilliam博士,首席执行官Arrayjet。McWilliam还讨论了非接触式微阵列打印技术以及这些工具可以为高通量筛选提供的优势。


莎拉·惠兰(Sarah Whelan)(SW):您能简要解释什么是微阵列以及它们的用途?


Iain McWilliam(IM):微阵列通常是一个玻璃载玻片,该载玻片在微型2D网格中固定在数千个生物或化学探针中。然后在微阵列上孵育感兴趣的样品,并与荧光标记物检测到特定的相互作用。最常见的是,微阵列用于高通量筛查,药物发现中的HIT检测和多重诊断。比利时罗马尼亚比分直播它们通常被称为用于实验室测试的微芯片。


SW:早期的微阵列专注于DNA分析,您还能通过此技术打印和分析什么?


IM:现代微阵列可以用蛋白质,抗体,抗原,聚糖,细胞裂解物和小分子印刷。这使其可用于广泛的应用,包括蛋白质组学,抗体表征,生物标志物发现,护理点诊断,靶标识别和药物发现,除了它们分析基因表达的“原始”目的。比利时罗马尼亚比分直播


SW:喷墨微阵列打印机的主要特征是什么?它们如何工作?


IM:Microarrays require tiny volumes of thousands of samples to be dispensed precisely and consistently.Arrayjet的微阵列使用专为高质量图形设计的工业级喷墨打印头,该印刷品已适用于专利工程以打印生化样品。


Samples are loaded into the base of the printhead with a specialized aspirator. The aspirator detaches and the printhead glides across the surface, depositing samples in a user-defined pattern without stopping or making contact. The whole print-space is contained within a HEPA-filtered environment with tightly controlled humidity and temperature. High-speed cameras mounted by the printhead follow the printing and feed images to our AI-driven software, guaranteeing print quality in real time.


总的来说,这意味着喷墨微阵列的精度,可靠性和速度最高。


SW:这种非接触式阵列打印技术比其他打印技术具有什么优势?


IM:首次发明时,通过使用销钉将样品直接发现在表面上,打印微阵列。最近,contactless microarray options are favored由于它们更快,更可靠,因此交叉污染和更好的斑点形态减少。


Many contactless dispensing instruments use glass tips, akin to a drawn-glass pipette, but these are difficult to calibrate, can limit layout options, break easily and cost thousands of dollars to replace. In contrast, an inkjet printhead is robust and can switch microarray layouts at the push of a button.


对于筛查操作,吞吐量至关重要,并且喷墨微阵列的压倒性优势是速度。它们还具有很高的可重复性,非常灵活并容纳简单的步入式操作。较新的,更快的喷墨方法意味着微阵列是筛选应用程序以前未曾考虑过的成本效益的选择。


SW:您能告诉我们更多有关您的Arrayplex Spot-On Spot微阵列平台的信息吗?该技术的应用是什么,它提供了哪些其他好处?


IM:Arrayplex™是我们的专利,基于阵列的技术,用于快速组合库筛选。It involves printing and immobilizing a set of capture samples onto a set of slides, then printing a second test library on top. The throughput is phenomenal – over two million unique interactions can be generated in a weekly experimental cycle. We most commonly use this for immunotherapeutic antibody hit detection by screening human tissue samples against hybridoma antibody libraries, but the technology is compatible with other proteins, nucleic acids and small molecules.


SW:您能为我们提供一些使用喷墨微阵列技术最近成功的例子吗?


IM:目前,一个特别令人兴奋的领域是对小分子和生物制剂进行药物筛查。寻找新平台的毒品猎人已转向微阵列,以替代传统的高通量筛查方法和质谱法。


对于小分子,Arrayjet采用了马萨诸塞州理工学院,国家癌症研究所和Scripps的团体开创的流程,并在简化的固定和检测方案中可以访问它们。first commercial platform for small molecule microarrays。数十个可以在幻灯片上打印成千上万种小分子药物样化合物并与感兴趣的RNA或蛋白质一起孵育,以寻找新型的配体 - 目标命中率。


在其他地方,对于生物标志物发现,我们最近发表了申请注释以支持从停用的接触销技术转移到现代喷墨微阵列中的反相蛋白阵列- 极大地提高速度,准确性,密度和斑点形态。


其他examples include a蛋白质 - 肽阵列用于分析CoVID-19,还有我们的与Kemri-Wellcome Trust合作,以“小型化”其ELISA,以进行有效的疟疾疫苗靶标识别, which increased its productivity by 99%.


SW:这些更现代的高级微阵列与其他高通量技术相比如何?他们能否帮助满足对高通量筛查的不断增长的需求?


IM:有许多高通量筛查的方法包括基于细胞的测定,用珠子多路复用,RNA测序和质谱法。微阵列是一种既定,验证的技术,能够补充和增强这些方法。


不仅用于DNA,微阵列还可以筛选出各种生化样品 - 而且喷墨微阵列可以简单,可靠,迅速地做到这一点。作为吞吐量的一个例子,Arrayjet Mercury微阵列:

  • 每秒的沉积超过700个功能
  • 可以在一批中加载超过18,000个样品
  • Prints up to 1,000 slides in a single batch
  • 每样品仅需要0.5 µl的1000个幻灯片
  • Can fit 100,000 features onto each microscope slide


使用喷墨技术,Arrayjet的微阵列instruments服务能够满足行业对具有成本效益,高质量和高通量筛查的行业需求。


Iain McWilliam博士was speaking to Sarah Whelan, Science Writer for Technology Networks.

认识作者
莎拉·惠兰(Sarah Whelan)
莎拉·惠兰(Sarah Whelan)
科学作家
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