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世界上第一个测序的Dingo基因组表明它们与家犬不同
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一个新学习已经第一次对澳大利亚沙漠丁山的基因组进行了测序,这是一只野狗,在地理上与狼和家犬都隔离了数千年。研究人员,由La Trobe University的领导比尔·巴拉德教授,表明存在结构上的差异,可以将野狗基因组与犬种的基因组分开,并且这些变化对野蛮的生理乃至其肠道微生物组有影响。

澳大利亚的顶级狗

野狗在澳大利亚生态系统中起着重要作用。巴拉德在新闻稿中解释说:“野狗是澳大利亚的'最高阶层捕食者',这意味着它们会影响环境中的一切。”


尽管如此,野狗的起源仍不清楚。野狗本质上是野狗还是不受污染的独特犬齿?这场辩论助长了当前的研究,该研究分析了从纯野生野狗(与家狗杂交的杂交)中获得的基因组,从而造成了许多狗 - 丁多杂种,称为桑迪。桑迪的基因组序列的资金只有在她赢得比赛后才到达世界上最有趣的基因组在2017年。


桑迪的基因组是使用精选技术组装的,产生了23.5亿个碱基的序列。然后将基因组与代表驯养犬科的五只犬只的狗进行了比较:德国牧羊犬,拳击手,拉布拉多,巴斯森吉和大丹恩。


为了创建涉及家犬和野狗的进化树,需要一个参考基因组,与所研究的动物在遗传上不同,这被称为外组。在这里,作者选择了格陵兰狼作为群体,这是一个早于狗和欧亚狼的亚种,并且很少与其他犬科动物种群混合。

野狗差异

分析表明,与澳大利亚其他犬科动物分离的野狗基因组与家养犬的品种有所不同,与家用品种相比,野狗的犬种有多达2400万个独特的基础。


桑迪的基因组和该基因组之间至少有三种大染色体差异参考狗基因组,这是从拳击手品种中取的。一个实质性差异,在上一个学习,是Dingo基因组只有一个编码胰酶中一种酶的基因的副本,称为淀粉酶。家狗有多个该基因的副本,在功能上有助于淀粉消化。


作者想探讨这样的基因组差异是否会对犬科的生理产生影响。他们指出,一些与营养代谢有关的基因转录本,例如GAL3ST1,,,,在野狗和繁殖犬中更高度表达。


为了测试这些变化是否会影响犬科代谢食品的如何代谢,他们检查了15天的17个野狗和15只德国Shephard Dogs(与野狗基因组相似的品种)。用抗生素处理动物,然后给予益生菌以最大程度地减少其微生物组的差异。然后,在实验期间,他们喂了类似的饮食(其中两个野狗通过吞噬了在实验期间掉入其围栏的不幸的负鼠,使他们的口感增添了味道)。该分析证实,在研究结束时,在丁木木中降低了淀粉酶,其胆固醇和低密度脂蛋白水平明显更高。微生物组分析还提出了家犬和野狗之间的差异。


最终,作者得出的结论是,他们的证据表明,野狗基因组与该家犬“大幅分歧”,尽管他们指出,与格陵兰狼相比,这些犬科动物都保持相对相似。

牲畜损失要归咎于野狗吗?

他们还认为,野狗和家狗之间的基因组和代谢差异可能会对澳大利亚如何管理丁木犬产生影响。在澳大利亚,野狗和野狗被视为同义词,在那里它们也被视为威胁放牧牲畜。巴拉德说,他们的数据意味着野狗已经进化为吃澳大利亚本地物种,例如有袋动物和爬行动物。“基于这一新知识,我们假设野狗吃在包括绵羊在内的农场动物的可能性要小得多。如果我们是正确的,那么目前,农民认为野狗杀死了他们的股票,可能是野生犬。”巴拉德说。


As dingoes are an apex predator in Australia, Ballard suggests that overzealous dingo control could have major ramifications for Australian ecosystems: “If dingoes aren’t given the protection they deserve, it will upset the country’s ecological balance—potentially leading to environmental issues like erosion and species extinction.”


关于野狗仍然有未解决的问题。该团队呼吁对其生态系统中的纯采田进行更详细的分析。但是他们的研究确实表明了基因组学对地球最具标志性动物的奥秘的力量。巴拉德总结说:“这使我们更清楚地了解了野狗如何发展 - 从科学的角度来看,这令人着迷,但也开辟了各种新方法来监测其健康并确保其长期生存。”


参考:MA,Yadav S,Dudchenko O等。澳大利亚野餐是现代品种犬的早期分支。科学。ADV。2022;8. doi:10.1126/sciadv.ABM5944

认识作者
Ruairi J Mackenzie
Ruairi J Mackenzie
高级科学作家
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